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Tag：教程软件科技人工智能设计操作系统推特aitiwwer科技猎手02月01日
各位深耕研究领域的朋友们，大家好。今天我要给大家分享一个用Palmer查看F3输出结果，以及怎么制作一个可发表级别互作位点图的方法。
首先这是我们一般状态下，在F3当中如果download结果的话，它会出现的一个文件夹，处于压缩文件夹的形式。我们选择当中的model 0的saf文件，这个文件一般是互动效果最好的，因此我们把它选择复制并且粘贴好，这个时候我已经复制粘贴到桌面上面了，紧接着我们把它拖到我们的payer软件当中。
完成文件导入后，我们首先可以进行第一个操作：更改背景色。我们选择display background，选择White，这样我们就可以把背景从黑色变成白色，更便于后续的结构观察与图稿制作。
接下来进行更名和改色的操作。首先我们把右下角的调整栏把它变为欠玺，点选其中的一条蛋白质链，选中之后我们把它进行更名reland selection，这里我把它变为AAA enter。紧接着改色选c color，把它变为蓝色，这里你选随便选什么颜色都可以。
选完之后朋友们注意了，这里一定要把这个图层选为非选中的状态。我们把图层再点一下，让它由灰色变成黑色，这样它就处于一个非选中的状态了。紧接着我们点击第二条链，依次重复上面的操作：Realme selection，我们把他名为BBB按回车，这个时候我们依次再对它进行改色，改成松石绿色。
完成蛋白结构的基础设置后，我们就可以去找它的互作位点了。选AA和B的任何一个图层都可以进行这个操作：Action, find polar contacts, two other items in object。点完之后我们就可以发现它的淡淡的黄色的小棒就是它的氢键了。我们要首先把它的结构显示出来，选S设为sticks，紧接着B图层也设为sticks，把棍状结构展示出来后回到右下角，把chains变成redial ce氨基酸残基，放大图面调整位置，点击末端连接的残基，拖到远景确认没有遗漏的位点。
之后我们把两者的棍状结构全部隐藏head sticks，b也是head sticks，此时卡通结构可能干扰视觉判断，我们可以选择setting transparency，选择卡通结构，把它的透明度调整为80%，这样就不会干扰视觉效果了。然后选择我们刚刚点出来的图层，选择show show sticks展示它的棍状结构，这样蛋白互作的位点就展示得非常清楚了。
我们还可以进行辅助操作让位点显示更直观：选择label l选择read duce显示氨基酸残基。如果残基文字嵌在氨基酸里显示不直观，可进入编辑模式，按住control键拖拉调整位置，用control加E取消操作；调整好后选择setting label show connectors显示连接线，进一步提升直观性。此时可发表级别的互作位点图就制作完成了。今天的分享就到这里了，谢谢大家。扫码可以免费分析蛋白与蛋白三维互作模型及核心位点绘图。